Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Vmn1r196Q5SVD5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Vmn1r196Q5SVD5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Vmn1r196Q5SVD5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Vmn1r196Q5SVD5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Vmn1r196Q5SVD5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vmn1r196Q5SVD5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Vmn1r196Q5SVD5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Vmn1r196Q5SVD5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Vmn1r196Q5SVD5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Vmn1r196Q5SVD5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Vmn1r196Q5SVD5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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