Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tnni3kQ5GIG6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms