Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig2Q52KR2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms