Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ulk4Q3V129 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms