Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933416C03RikQ3V063 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms