Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkx6-3Q3UHX8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Nkx6-3Q3UHX8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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