Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf149Q3U2C5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf149Q3U2C5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf149Q3U2C5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf149Q3U2C5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf149Q3U2C5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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