Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpusd2Q149F1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms