Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Neurl1bQ0MW30 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms