Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q08AU9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q08AU9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q08AU9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q08AU9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q08AU9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q08AU9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms