Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cnn1Q08091 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cnn1Q08091 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cnn1Q08091 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cnn1Q08091 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cnn1Q08091 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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