Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NrepQ07475 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms