Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cntn3Q07409 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms