Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr16c6Q05A13 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms