Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snai1Q02085 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snai1Q02085 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms