Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Apoa1Q00623 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Apoa1Q00623 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms