Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp1P97350 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms