Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ldb1P70662 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ldb1P70662 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ldb1P70662 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ldb1P70662 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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