Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms