Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf6P70279 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms