Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Crip1P63254 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms