Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms