Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm2P58774 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms