Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cldn18P56857 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cldn18P56857 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cldn18P56857 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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