Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SmoP56726 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SmoP56726 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SmoP56726 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SmoP56726 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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SmoP56726 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SmoP56726 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SmoP56726 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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SmoP56726 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SmoP56726 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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SmoP56726 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SmoP56726 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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SmoP56726 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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SmoP56726 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SmoP56726 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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