Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CartptP56388 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CartptP56388 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CartptP56388 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CartptP56388 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CartptP56388 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CartptP56388 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CartptP56388 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CartptP56388 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CartptP56388 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CartptP56388 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CartptP56388 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CartptP56388 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CartptP56388 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CartptP56388 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CartptP56388 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CartptP56388 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CartptP56388 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CartptP56388 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CartptP56388 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CartptP56388 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CartptP56388 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CartptP56388 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CartptP56388 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CartptP56388 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CartptP56388 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CartptP56388 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CartptP56388 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CartptP56388 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CartptP56388 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CartptP56388 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CartptP56388 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms