Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp1P52624 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp1P52624 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upp1P52624 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms