Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms