Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psen1P49769 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms