Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rbp3P49194 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms