Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TfamP40630 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TfamP40630 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TfamP40630 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TfamP40630 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TfamP40630 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TfamP40630 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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