Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms