Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab20P35295 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms