Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa2P31245 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms