Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnd3P30282 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccnd3P30282 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms