Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp3P28862 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp3P28862 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms