Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RxrbP28704 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RxrbP28704 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrbP28704 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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RxrbP28704 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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RxrbP28704 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrbP28704 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RxrbP28704 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrbP28704 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrbP28704 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrbP28704 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrbP28704 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrbP28704 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrbP28704 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RxrbP28704 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrbP28704 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrbP28704 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RxrbP28704 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrbP28704 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrbP28704 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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