Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
U2af2P26369 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms