Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RdxP26043 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RdxP26043 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RdxP26043 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RdxP26043 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RdxP26043 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RdxP26043 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RdxP26043 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RdxP26043 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RdxP26043 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RdxP26043 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RdxP26043 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms