Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Ggta1P23336 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ggta1P23336 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Ggta1P23336 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Ggta1P23336 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Ggta1P23336 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Ggta1P23336 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Ggta1P23336 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ggta1P23336 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms