Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcaP20444 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms