Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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PdgfaP20033 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PdgfaP20033 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PdgfaP20033 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PdgfaP20033 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PdgfaP20033 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfaP20033 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PdgfaP20033 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PdgfaP20033 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PdgfaP20033 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfaP20033 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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