Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18524 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18524 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18524 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18524 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms