Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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DmdP11531 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DmdP11531 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DmdP11531 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DmdP11531 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DmdP11531 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DmdP11531 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DmdP11531 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DmdP11531 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DmdP11531 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DmdP11531 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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DmdP11531 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DmdP11531 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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DmdP11531 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DmdP11531 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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DmdP11531 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DmdP11531 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DmdP11531 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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DmdP11531 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DmdP11531 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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DmdP11531 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DmdP11531 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DmdP11531 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DmdP11531 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DmdP11531 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DmdP11531 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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DmdP11531 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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DmdP11531 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DmdP11531 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DmdP11531 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DmdP11531 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DmdP11531 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DmdP11531 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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DmdP11531 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DmdP11531 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DmdP11531 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DmdP11531 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DmdP11531 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DmdP11531 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DmdP11531 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DmdP11531 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DmdP11531 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DmdP11531 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DmdP11531 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DmdP11531 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DmdP11531 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DmdP11531 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DmdP11531 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DmdP11531 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DmdP11531 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DmdP11531 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DmdP11531 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms