Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spp1P10923 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spp1P10923 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spp1P10923 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spp1P10923 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spp1P10923 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spp1P10923 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spp1P10923 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spp1P10923 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spp1P10923 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spp1P10923 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spp1P10923 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spp1P10923 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Spp1P10923 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spp1P10923 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Spp1P10923 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Spp1P10923 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Spp1P10923 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spp1P10923 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spp1P10923 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spp1P10923 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spp1P10923 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Spp1P10923 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spp1P10923 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spp1P10923 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spp1P10923 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Spp1P10923 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Spp1P10923 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spp1P10923 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spp1P10923 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spp1P10923 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spp1P10923 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spp1P10923 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms