Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxb7P09024 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms