Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TtrP07309 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtrP07309 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtrP07309 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtrP07309 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TtrP07309 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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TtrP07309 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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TtrP07309 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtrP07309 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtrP07309 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtrP07309 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtrP07309 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtrP07309 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtrP07309 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtrP07309 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtrP07309 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TtrP07309 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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