Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa4P06798 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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