Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P06320 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06320 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06320 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06320 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06320 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06320 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06320 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06320 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06320 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06320 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06320 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06320 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06320 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06320 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06320 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06320 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms