Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccl20O89093 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccl20O89093 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccl20O89093 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccl20O89093 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccl20O89093 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccl20O89093 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccl20O89093 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccl20O89093 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl20O89093 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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